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税務調査について徹底解説!当日の流れと注意すべきチェックポイント

公開日:2025/02/17

最終更新日:2025/01/24

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税務調査が入ると聞くと、多くの人が不安を感じるでしょう。

「どのような種類があるのか」「対象となる確率や条件は?」「準備や対応方法は?」など、疑問を持つ方も少なくありません。本記事では、税務調査の基本から実際の流れ、対策までをわかりやすく解説します。

この記事を読めば、税務調査への理解が深まり、適切な対応ができるようになることでしょう。

税務調査に備えたい方や、正確な知識を得たい方はぜひ参考にしてください。

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税務調査とは?

税務調査とは、国税庁や税務署が納税者の申告内容が適切かどうかを確認するために行う調査 です。納税者が税法に基づき適切に税金を納めているかを確認するため、国税庁や税務署が実施する重要なプロセスです。調査は、税法の遵守と公正な税制を維持するために不可欠な役割を果たしています。

調査では、帳簿や証憑(領収書や請求書など)の確認、関係者へのヒアリング、取引の実態調査 などが行われます。申告内容に不備や誤りが見つかった場合、納税者には修正申告や追徴課税が求められる場合 があります。また、意図的な不正行為が確認された場合には、罰則が適用される可能性 もあります。

税務調査は、企業や個人事業主を対象に行われるもので、納税者が適切な準備を行うことが重要です。

税務調査の種類とその特徴

任意調査と強制調査の違い

任意調査は、一般的な企業や個人事業主を対象に行われる調査形式 です。調査は、事前に税務署から通知を受け、日時を調整したうえで実施されます。納税者の協力を得ながら、帳簿や証憑を確認し、申告内容の正確性の確認が目的 です。

任意調査では、調査官が納税者に対して申告内容や帳簿の疑問点を質問し、不備や誤りがあれば適切に修正する機会が与えられます。通常の税務調査に該当し、多くの納税者に適用されます。

一方で、強制調査(別名:マルサ調査)は、重大な脱税が疑われる場合に実施される厳格な調査形式 です。調査は裁判所の令状に基づき、事前通知なしで行われる ことが特徴です。調査官は、納税者の意向に関係なく必要な資料を押収し、詳細な調査を進めます。

強制調査は、組織的な脱税や大規模な不正行為が疑われるケースに限定されるため、対象者にとっては極めて負担が大きい調査となります。

2種類の調査は、目的や手法が異なりますが、いずれの場合も適切な対応が求められます。

種類 特徴 実施対象
任意調査 事前通知あり
納税者と協力して実施
多くの納税者が対象
一般の企業・個人事業主
強制調査 事前通知なし
裁判所の令状が必要
資料の押収が可能
重大な脱税が疑われる場合

税務調査の対象になる確率と特徴

法人が税務調査対象になりやすい条件

法人が税務調査の対象となるかどうかは、申告内容や経営状況に大きく依存 します。特定のリスク要因がある場合、税務署は不正の可能性を疑い、調査を実施 をします。

まず、売上や利益が急激に増加した場合は注意が必要 です。急激な変化は、取引内容や申告内容に不自然な点がないか確認するきっかけとなります。また、大幅な経費計上が目立つ場合も調査対象になる可能性が高まります。経費の計上額が他社と比べて著しく多い場合、不正な経費処理が行われていると疑われる場合があります。

さらに、過去に税務調査で指摘を受けた企業も、再調査のリスクが高まります 。同様に、同業他社との比較で異常な数値が見られる場合や、税務署が重点的に調査している業種に該当する場合も注意が必要です。特に、中小企業は帳簿管理の不備や税務知識の不足が原因で、調査対象になる傾向があります。

個人が税務調査対象になりやすい条件

個人の場合も、異常な申告内容や取引が調査対象となる要因 です。特に、高額な収入を得ているフリーランスや副業を行う個人は税務調査のリスクが高くなります

例えば、経費の割合が過剰に高い場合や、収入に対して経費が異常に多い場合は、経費計上の正当性が疑われる可能性があります。また、申告内容が前年と大きく異なる場合も、税務署が注目するきっかけとなります。

さらに、不動産収入や株式取引の収益を得ている場合も注意が必要です。収入は記録や申告が正確であることが求められます。不動産の賃貸収入での経費計上や、株式取引での損益通算の誤りがある場合、調査対象となる可能性が高まります。

税務調査の流れとチェックポイント

税務調査の基本的な流れ

税務調査の基本的な流れは以下の通りです。

1.事前通知
任意調査では通常、調査開始の1~2週間前に税務署から通知があります。通知には、調査日時や調査内容、必要な準備物などが記載されています。一方、強制調査では事前通知は行われません。

2.初回面談
調査開始日に税務調査官が訪問し、調査の目的や対象範囲を説明します。企業の場合は経理担当者や経営者の対応が一般的です。

3.帳簿・証憑の確認
調査官は、過去数年間の帳簿や証憑を確認し、不明点や不整合がないかをチェックします。不備が見つかった場合、詳細な説明を求められることがあります。

4.ヒアリング
必要に応じて、経営者や関係者へのヒアリングが行われます。取引内容や申告内容の詳しい説明を求められる場合があります。

5.調査結果の説明
調査が終了すると、税務署から調査結果が通知されます。不備があれば修正申告や追徴課税が求められる場合があります。

ステップ 内容
事前通知 調査開始1~2週間前に通知が届く(任意調査のみ)
初回面談 調査官が訪問し調査目的や範囲を説明
帳簿・証憑の確認 過去数年間の記録や証憑を確認
ヒアリング 経営者や関係者への質問
調査結果の説明 調査結果通知、不備があれば修正申告や追徴課税が求められる

特に注意すべき確認ポイント

税務調査では、以下の点が特に注意深く確認されます。

・売上の漏れ
売上計上が適切に行われていない場合、不正行為とみなされる可能性があります。現金収入や取引履歴の記録が不十分だと、疑われることが多いです。

・経費の妥当性
経費が実際の業務に関連しているか、領収書や請求書が適切に保管されているかが確認されます。プライベートな支出を経費として計上している場合は、指摘を受ける可能性があります。

・税金の控除・還付の適正性
特別控除や還付申請に誤りがある場合、不備として扱われる可能性があります。特に、高額な控除が適用されている場合は注意が必要です。

確認項目 内容
売上の漏れ 現金収入や取引履歴の記録が適切か
経費の妥当性 業務に関連した経費か、領収書や請求書が保管されているか
税金控除・還付の適正性 特別控除や還付申請に誤りがないか

税務調査に備えるための対策

事前準備と心構え

税務調査への対応を円滑に進めるには、事前の準備が欠かせません。通知を受けたら、まず帳簿や証憑類を整理し、調査対象期間の記録を確認 しましょう。特に、記録が不十分な場合は、早急に修正や補完を行い、不備が残らないよう整備が重要です。

帳簿の記録が調査官に提示できる状態であることが、信頼の基盤 となります。例えば、売上や仕入れに関する証憑が欠けている場合、不信感を与える可能性が高まります。適切な資料が揃っていれば、調査官への説明がスムーズに進むため、問題の解決が早まります。

心構えとしては、落ち着いて誠実な対応が重要 です。不備を隠そうとする行為は、状況を悪化させる原因となります。不正行為を疑われないためにも、誠実な姿勢を保つことが肝要です。

顧問税理士・顧客との連携

顧問税理士のサポート活用で、税務調査への対応はより効果的 になります。税理士は専門知識を活かして、税務調査の事前準備や対応方法に的確な助言を提供します。また、税理士が調査当日に同席すれば、調査官とのやり取りが円滑に進む可能性が高まります。

さらに、顧問税理士は調査官に対して技術的な質問への回答や、指摘事項の詳細な説明を行う役割 を果たします。サポートにより、調査対象者の負担軽減が期待できます。

また、顧客や取引先との連携も重要な要素です。税務調査では、取引に関する情報や記録の提出を求められる場合があります。必要な範囲で迅速に情報を提供できる体制を整えておくことが、調査の効率化に寄与します。具体的には、取引先の連絡先や関連する証憑を整理し、問い合わせが発生した際に即時対応できるよう準備しておくことが理想です。

税務調査での誤り指摘への対応方法

修正申告の手順

修正申告は、税務調査で指摘された誤りを訂正するための手続きです。正しい申告をやり直すことで、適切な税額を確定させることができます。

1.指摘内容の確認
税務署から指摘を受けた場合、まず内容を正確に把握します。指摘事項が曖昧であれば、税務署に詳細な説明を求めましょう。指摘内容が理解できないまま対応を進めると、さらなる誤りを生む可能性があります。

2.修正内容の検討
指摘された不備に基づき、修正すべき点を特定します。記録や帳簿をもとに、誤りの原因を突き止めることが重要です。また、顧問税理士への相談で、専門的な視点からの適切な修正案が得られます。

3.修正申告書の作成と提出
修正内容を反映した申告書を作成し、速やかに提出します。修正申告には提出期限が設けられているため、迅速な対応が求められます。期限を守ることで、追徴課税額の軽減やペナルティの緩和が期待できます。

手順 内容
指摘内容の確認 指摘事項を正確に理解し、税務署に詳細を確認する
修正内容の検討 記録や帳簿を基に誤りの原因を突き止め、修正案を検討
修正申告書の作成と提出 正確な内容を反映し、期限内に修正申告書を提出する

更正の請求について

更正の請求は、税務署の指摘が誤っている場合に行う、納税者の権利を守るための手続きです。正当な理由をもとに税額の訂正や還付を求めることができます。

1.誤認の証拠収集
税務署の指摘が誤りである場合、証拠を整理して提示する必要があります。具体的には、帳簿や取引記録、領収書などが有効な証拠で指摘内容が誤っていることを証明します。

2.更正の請求書の作成と提出
収集した証拠をもとに、更正の請求書を作成します。請求書には、税務署の誤りに関する具体的な説明と訂正を求める理由を明確に記載します。提出時には必要な証拠書類を添付し、申請を完了させます。

3.審査結果の待機
更正の請求は、税務署の審査を経て決定されます。審査期間中に追加の資料や説明を求められることもありますが、冷静かつ丁寧な対応が重要です。適切な対応により、誤認による不当な税負担を回避できます。

税務調査に関するよくある質問

税務調査の頻度はどのくらいか?

税務調査の頻度は、業種や規模、過去の申告内容に大きく左右 されます。中小企業の場合、一般的に数年に一度程度の頻度で調査が行われます。一方で、特定のリスク要因がある場合は、より高頻度で調査が実施される可能性があります。

例えば、過去に申告漏れや誤りが発覚した場合、税務当局は企業を重点的に監視します。さらに、業種によっても頻度は異なり、現金取引が多い業種(飲食業、小売業など)は調査対象になりやすいとされています。

個人事業主やフリーランスも例外ではありません。特に高収入である場合や、経費計上が不自然な場合は調査対象になることがあります。税務当局は申告内容の信憑性を精査するため、不審点がある場合にはより詳細な調査を行う傾向があります。

税務調査で最も注意すべき点は?

税務調査で重要なのは、申告内容の正確性と透明性 です。調査が入った場合、過去の記録や資料を整理し、不明点があればスムーズに説明できるようにしておく必要 があります。特に、取引記録や領収書などの書類をしっかり保管し、必要に応じて提示できる状態を保つことが求められます。

調査中に焦って不自然な対応を取ることは禁物です。不正を隠そうとすると、状況を悪化させるだけでなく、追加課税や罰金、さらには信用の失墜につながる可能性があります。顧問税理士がいる場合は、事前に相談し、調査への対応方法を具体的に確認しておくことが重要です。

また、税務調査は納税者の義務を確認するためのものであり、不安を抱える必要はありません。適切な対応で、問題を円滑に解決できるケースがほとんどです。

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税務調査について徹底解説 -まとめ

この記事では税務調査について詳細を解説しました。

税務調査は、納税者の申告内容が正しいかどうかを確認するために行われるもので、一般的な「任意調査」と重大な脱税が疑われる際に行われる「強制調査」の2種類があります。調査対象は法人や個人事業主で、売上や利益の急増、過剰な経費計上などが調査のリスク要因となります。調査は事前通知や帳簿確認、ヒアリング、結果説明を経て進められ、不備がある場合には修正申告や追徴課税が必要になることがあります。対策として、帳簿や証憑類を整備し、顧問税理士の助言を活用することで、スムーズな対応が可能です。税務調査のリスクは業種や過去の申告内容に影響されますが、適切な準備と誠実な対応がトラブルを防ぐカギとなります。

この記事が皆様のお役に立てば幸いです。

執筆 ・ 監修

平川 文菜(ねこころ)

熊本出身。2018年京都大学卒業。在学中より税理士試験の勉強を始め、2018年12月に税法三科目(法人・消費・国徴)を同時に合格し、官報合格を果たす。 2018年9月よりBIG4 税理士法人の一つであるKPMG税理士法人において、若手かつ女性という少数の立場ながら2年間にわたり活躍。税務DDやアドバイザリーといった幅広い業務に従事。 2020年9月より、外資系戦略コンサルティングファームであるボストンコンサルティンググループに転職。戦略策定から実行支援まで幅広い業務に従事。2024年12月にフリーランスとして独立。